Protein Skimmer hoặc Máy tách bọt được sử dụng để loại bỏ chất rắn mịn và protein hòa tan khỏi nước. Skimmer protein loại bỏ các hạt hòa tan khỏi dòng nước thải bằng cách hấp phụ hạt ở bề mặt khí-lỏng. Các phân tử nước bao quanh một bề mặt không khí có xu hướng tự sắp xếp. Máy tách bọt đặc biệt thích hợp để loại bỏ các hạt nhỏ hơn 30 micron và các hạt có điện tích. Độ mặn của nước càng cao thì hớt bọt càng hiệu quả do sự hình thành các bọt khí mịn hơn do sức căng bề mặt tăng lên.

Skimmer thường hoạt động với dòng chảy ngược khi nước đi vào gần đỉnh của lò phản ứng và không khí được bơm vào gần đáy bằng các vòi phun Venturi. Các skimmer có thể được thiết kế tùy chỉnh cho nhiều loại dòng chảy khác nhau và có thể được sản xuất theo hình chữ nhật hoặc hình trụ. Sự lựa chọn ưu tiên của nhựa có thể là Polypropylene (PP) hoặc Polyethylene (PE) đều là những vật liệu bền, chắc và trơ về mặt hóa học.